دولت ابراهیم رئیسی شماری از اساتید دانشگاه، از جمله آرش اباذری، محمد فاضلی، حسین مصباحیان، رضا امیدی، امیر مازیار، محمد راغب، امیر نیک‌پی و اساتید دیگری را به بهانه‌های «عمل نکردن به تعهدات علمی»، «کسب نکردن امتیازات قانونی ادامه خدمت» و دیگر بهانه‌های مختلف» از دانشگاه اخراج کرده است.
مهدی خویی، استاد علوم اجتماعی دانشگاه علامه طباطبایی نیز از این دانشگاه اخراج شده و نوشته است: «بعداز ۷ سال تدریس نامه‌ی قطع همکاری (اخراج) گرفته‌ام و از خانه ام یعنی دانشگاه درحال رانده شدن هستم و مستأصلم که از این ظلم شکایت به کجا برم.»