بر اساس گزارش دانشجویان از کمیته‌ی انضباطی دانشگاه یزد، این دانشگاه طی فرایند‌های مختلف دانشجویان را در کمیته انضباطی مورد آزار قرار می‌دهد. این آزار‌ها از جانب معاونت دانشجویی، نماینده‌ی نهاد رهبری و ریاست دانشگاه به شکلی مداوم متوجه دانشجویان شده است که با فشار زیاد و تهدید از طرف دانشگاه، در سکوت خبری تداوم یافت.
▫️بلاتکلیفی در وضعیت تحصیلی؛
دانشجویانی که در این دانشگاه حکم انضباطی قطعی دریافت نکرده بودند با ممنوعیت‌های طولانی‌مدت از تحصیل و امکانات رفاهی مواجه شدند و پس از دریافت حکم قطعی نیز مجددا از تحصیل آنان ممانعت می‌شود. همچنین در مواردی دانشگاه با اخذ تعهد یا گذراندن بخشی از محکومیت انضباطی، به دانشجویان قول بازگشت به تحصیل می‌دهد اما دقیقا در بازه انتخاب واحد، سامانه‌ی اموزشی آنان را مسدود می‌کند. این اقدامات کاملا غیر قانونی‌ای انجام هستند و مسببین آن باید مورد پیگرد قرار بگیرند.
▫️تهدید دانشجویان و دوستانشان در صورت عدم همکاری با حراست؛
در گزارشات متعدد از این دانشگاه، دانشجویان در کمیتههای انضباطی تهدید شده‌اند که چنانچه نام دوستانشان را فاش نکنند، پرونده‌های انضباطی آنان هرگز بسته نخواهد شد. همچنین دوستان و نزدیکانِ دانشجویانی که در کمیتههای انضباطی محکوم شده یا مورد آزار قرار گرفتند، تهدید می‌شوند که در صورت انتشار اخبار دوستانشان، خودشان نیز از تحصیل محروم خواهند شد. این تهدید‌ها حتی در مواردی عملی نیز می‌شوند و چندین دانشجو تاکنون، صرفا بابت حمایت از دوستانشان تعلیق و محروم از تحصیل شده‌اند.
▫️اجبار دانشجو به درخواست انتقالی از دانشگاه؛
در یک مورد دانشگاه بدون ابلاغ هیچگونه حکمی دانشجو را از تحصیل منع کرده است و به او گفته می‌شود که یا باید درخواست انتقالی بدهد و یا اخراج خواهد شد. همچنین در فرایندی غیرقانونی، حذف پزشکی یک درس که قانونا باید پذیرفته می‌شد را در گرو این درخواست انتقالی قرار دادند. پس از امتناع این دانشجو، دانشگاه از کمیته‌ی مرکزی وزارت علوم درخواست «تغییر محل تحصیل یا تبعید تحصیلی» وی را می‌کند و دانشجو را تا زمان پاسخ کمیته‌ی مرکز در حالت معلق از تحصیل قرار داده و اجازه انتخاب واحد به اون نمی‌دهد. این در حالی است که دانشگاه پیگیری این حکم را نیز به خودِ دانشجو حواله کرده است.
▫️آزارهای کلامی و جنسیتی در جلسات کمیته‌ی انضباطی؛
بر اساس گزارش‌‌ها دانشجویان-مخصوصا دانشجویان دختر- در جلسات کمیته‌ی انضباطی مورد توهین، فحاشی و آزارهای کلامی زیادی از جانب اعضای کمیته و رییس دانشگاه قرار گرفته‌اند. در مواردی معاونت دانشجویی دانشگاه و نماینده‌ی نهاد رهبری به دانشجو انگ بی‌بندوباری زده و او را به شدت مورد آزار و فحاشی قرار داده‌اند به حدی که دانشجو در جلسه دچار حمله‌ی قلبی و عصبی شده و نیاز به مراقبت پزشکی پیدا کرده بود.
این موارد تنها بخشی از بی‌قانونی‌ها و برخوردهای بیشرمانه‌ی مسئولین دانشگاه با دانشجویان است. همچنین در دیگر دانشگاه‌های کشور نیز شاهد برخوردهای غیرقانونی و غیر اخلاقی با دانشجویان هستیم که پیشتر نیز به آن‌ها اشاره شده است.